本校的歷史遠溯至一九五零年代下旬,當時天主教香港教區先在香港仔興辦小學,繼而申辦該區第一所政府資助文法中學。一九六五年夏天校舍落成,以堂區主保聖人伯多祿命名。按當年計劃擬只收錄男生,開校時僅設初中九班,其後兩年擴展至高中,共開設十五班。鑑於校務不斷拓展,而校舍設施日漸不敷應用,故自七二年起,教區當局與校董會多次向教育署申請擴建經費,以增建禮堂及特別室,可惜申請過程迭遇困難,遂令有關計劃一再拖延凡十數年。 自七六年起, 本校應政府要求,開設浮動班,全校遂按年由十五班遞增至十八班。八二年九月本校獲准開辦爭取多年之大學預科班,首屆只設理組學科,翌年再增設文組一班,全校亦於八四年遞增至十九班。
一九八七年政府正式批准資助本校增建禮堂及其他設施,並將附屬小學遷往對岸利東村的新建校舍,原址則撥歸本校改建及使用。八九年禮堂地基工程完成後,擴校計劃又再因建築費激增而受阻,全部工程遂延至九三年底始完竣。九三年九月,本校亦完成擴班,自中一至中七級共開設廿四班,包括中一至中五級各四班,中六、中七級各兩班。為使堂區兩所附屬小學男女學生享有平等機會升學,本校已由一九九五年九月起轉為男女子中學。此外,禮堂落成以後,本校仍不斷積極籌劃改善校舍,包括向政府申請在鄰近地段建校並遷入續辦。